Foldit, per giocare a mettere a posto i legami

Prevedere come la struttura primaria di una proteina definisca la sua struttura tridimensionale è molto difficile: i principi energetici che regolano il ripiegamento sono noti, ma comunque la previsione della struttura di una proteina richiede un'enorme potenza di calcolo.

Per questo è nato il progetto Foldit a metà strada tra gioco e scienza. Foldit è un gioco online riguardante, appunto, il ripiegamento proteico e la progettazione di nuove proteine, sviluppato all'università di Washington.

L'applicazione visualizza una rappresentazione grafica della struttura della proteina, che l'utente può manipolare con l'aiuto di un insieme di strumenti, al fine di trovare una struttura a più bassa energia e perciò più probabile.

Foldit prevede una serie di tutorial in cui l'utente “manipola” semplici proteine, ma periodicamente vengono rilasciati dei puzzle (proteine da progettare o di cui bisogna trovare la reale struttura tridimensionale), in modo da aiutare i ricercatori nella ricerca contro importanti malattie.

Quando l'utente partecipa a un puzzle, il programma calcola un punteggio, basato su come è stata ripiegata la proteina o su quanto efficace è la proteina progettata. Questi punteggi permettono di realizzare una classifica per ogni puzzle e una classifica globale degli utenti. Gli utenti di Foldit possono creare dei gruppi e condividere le “soluzioni” dei puzzle.

Secondo gli sviluppatori di Foldit, quante più strutture di proteine verranno identificate, tanto più sarà facile sviluppare farmaci per combattere malattie croniche come AIDS, cancro ed Alzheimer.

G.G.

http://fold.it/portal/

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